全基因组测序在线粒体疾病诊断中的应用
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文章图片及数据
数据
(A和C)线粒体基因组测序覆盖深度和(B和D) m.3243A>G异质性在2例患者的尸检组织中有所不同,固体组织中明显高于血液组织。A、C中的彩色线与B、d中的彩色条一致图1 c不同的组织。
(A)核基因组或线粒体基因组中WGS诊断的数量,来自n = 242名疑似线粒体疾病患者。(B)核基因组中线粒体疾病基因诊断的频率。(C) WGS检测发现1例癫痫发作、轻度眼下垂、视神经萎缩、小脑性共济失调、肌病、糖尿病、复发性假性梗阻和肝功能障碍患者4号染色体上有16.4兆酶对半合子缺失。(D) WGS检测到946碱基对的纯合缺失SPG7遗传性痉挛性截瘫并发小脑性共济失调、眼肌麻痹和感觉神经病变。MT =线粒体;全基因组测序。
(A) WGS检测到的致病mtDNA变异数量和(B)相应的变异异质性。(C)血液中发现了两个线粒体DNA单缺失,均在1%以下的异质性。尸检肌肉中发现了一个线粒体缺失,异质性更高,为15.7%,在(D)中更详细地显示,这突出了测序覆盖率和跨越缺失的reads。mtDNA =线粒体DNA;全基因组测序。
患者被分为6种临床表型(CPEO、中风样发作、视神经萎缩、MIDD、复杂和少症状),以突出WGS识别的致病核基因和线粒体DNA变异的频率。精确的分子诊断显示,每个亚组中未诊断的病例数以灰色显示。慢性进行性眼外肌麻痹;线粒体疾病;母亲遗传性耳聋和糖尿病;全基因组测序。
(A)有代表性的轴向T1加权图像显示E19患者脑病发作后右侧顶枕区信号强度异常灶性区域。注意在皮层下白质中也有小的高强度信号分布。(B)品红箭头表示B54患者丘脑高信号区,与成人Leigh综合征一致。
表
信件:快速在线通信
-
作者回应:利用全基因组测序诊断线粒体疾病
- 瑞安L戴维斯,研究员,悉尼大学
- 基肖尔R库马尔,神经学家,悉尼大学
- 埃路易斯沃森,神经学家,悉尼大学
- 卡洛琳米苏,神经学家,悉尼大学
2022年7月27日提交 -
读者回应:全基因组测序用于线粒体疾病诊断
- 凯瑟琳·R肖恩,临床研究员,剑桥大学
- 帕特里克·FChinnery,神经学家,剑桥大学
2022年7月14日提交
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