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文摘
背景和目标脑动静脉畸形(bAVM)是一种先天性疾病和出血性中风的主要原因。生殖系遗传变异bAVM的发病机制中起着关键作用。然而,疾病相关基因的生物相关性识别在先前的研究是难以捉摸的。在这项研究中,我们的目标是系统地研究生殖系变异的贡献bAVM和探索底层bAVM的发病机制至关重要的分子途径。
方法渊源者与零星bAVM连续加入了本研究从2015年11月到2018年11月,进行外显子组测序。控制聚合的个体没有已知血管畸形和临床或研究目的进行外显子组测序。保留控制数据集包括4609人,其中包括251名患者父母的样品测序。我们首先分析了新创变异的情况下,控制和执行通路富集分析。基于基因的罕见变异协会分析然后进行识别基因的变异明显丰富的情况下。
结果我们收集了一个exome-sequenced bAVM队列152三人小组和40单例对象组成。首先关注新创变异,我们观察到显著突变的负担可能gene-disrupting变异情况下与控制。通过执行所有产生的通路富集分析新创变体中确定的情况下,我们发现angiopoietin-like蛋白8 (ANGPTL8)监管途径明显丰富bAVM患者。通过一个exome-wide罕见变异协会分析利用4394内部外显子组数据作为控制,我们确认SLC19A3作为bAVM疾病相关基因。此外,我们发现SLC19A3变异的情况下最好是位于N′SLC19A3蛋白质。这些发现暗示表型的扩张SLC19A3有关的疾病与特定领域的效果。
讨论这项研究提供了洞察的生物学基础bAVM小说通过识别分子途径和候选基因。
术语表
- bAVM=
- 脑动静脉畸形;
- CADD=
- 结合注释相关的损耗;
- ccd=
- 共识的编码序列;
- CM-AVM=
- 毛细管malformation-arteriovenous畸形综合征;
- D-mis=
- 有害的错义;
- 《GQ》=
- 基因型质量;
- 炎症性肠病=
- 身份的血统;
- 乐金显示器=
- 可能gene-disrupting;
- MAPK=
- 增殖蛋白激酶;
- mTOR=
- 哺乳动物雷帕霉素靶;
- PI3K=
- 磷酸肌醇3-kinase;
- 照明灯具=
- 丧失不能容忍的概率
脚注
去半岛投注体育官网Neurology.org/N为充分披露。资金信息和披露认为作者相关的,如果有的话,年底提供这篇文章。
↵*这些作者的贡献同样co-first作者。
↵__这些作者的贡献同样共同通讯作者。
- 收到了2021年7月24日。
- 接受的最终形式2022年1月11日。
- ©2022美国神经病学学会的半岛投注体育官网
