宏基因组分析Pediatric-Onset多发性硬化症的肠道微生物组
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文摘
背景和目标鲜为人知的肠道微生物的功能潜力pediatric-onset多发性硬化症(MS)。我们利用患者的粪便样品进行宏基因组分析pediatric-onset女士和影响控制。
方法人≤21岁参加加拿大儿科脱髓鞘疾病网络提供一个粪便样品是合格的。20 MS患者出现症状(麦当劳标准)和< 18年被匹配到20控制按性别、年龄(±3年),粪便一致性,和种族。微生物分类和功能潜力估计从粪便样本得出的宏基因组相比读和疾病状态(vs女士控制)和疾病修饰药物(DMD)接触使用α多样性,相对丰度,并使用Wilcoxon流行等级和,ALDEx2,分别和费舍尔准确测试。
结果个人与女士13.6岁(平均)症状出现和8 DMD-naive。在粪便样本平均年龄分别为16.1和15.4年和控制参与者,女士分别;80%是女生。α多样性的酶和蛋白质由疾病或DMD状态(没有差别p> 0.20),但代谢途径、基因注释和微生物分类。个人(vs控制)女士表现出更高的甲烷生成患病率(优势比10,p= 0.044)和Methanobrevibacter丰富(日志21.7折变化(利物浦),p= 0.0014),但单纯乳酸发酵低丰度(利物浦−0.48,p= 0.039)。差异由DMD状态包括低磷酸丁酰转移酶DMD-naive vs暴露患者MS(利物浦−1.0,p= 0.033)。
讨论肠道微生物的功能潜力和分类不同个体间pediatric-onset女士和控制,包括产甲烷途径的患病率高古生菌乳酸发酵和损耗的途径。DMD暴露与butyrate-producing酶浓缩。这些发现表明肠道微生物组的女士可能干扰功能的潜力。
术语表
- 规律=
- additive-log比率;
- CPDDS=
- 加拿大儿科脱髓鞘疾病网络;
- DMD=
- 疾病的药物;
- 电子商务=
- 酶的佣金;
- KO=
- 《京都议定书》直接同源基因和基因组的百科全书;
- 利物浦=
- 日志2褶皱变化;
- 女士=
- 多发性硬化症;
- 或=
- 优势比;
- 酸盐=
- pediatric-onset多发性硬化症
脚注
去半岛投注体育官网Neurology.org/N为充分披露。资金信息和披露认为作者相关的,如果有的话,年底提供这篇文章。
CME过程:NPub.org/cmelist
- 收到了2021年4月21日。
- 接受的最终形式2021年12月13日。
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