罕见变异的全外显子组测序EIF4G1而且VPS35在帕金森病中
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摘要
摘要目的:最近,液泡蛋白分选35 (VPS35)和真核翻译起始因子4 γ 1 (EIF4G1)已被确定为2个导致帕金森病(PD)的基因。我们使用全外显子组测序对这两个基因的变异进行快速、并行分析。
方法:我们对213例PD患者和272例对照组进行了全外显子组测序。外显子组变异服务器数据库中频率<5%的罕见变异(rv)和我们自己的对照数据被考虑进行分析。我们使用RVASSOC和SKAT(序列核关联测试)以及单变量测试统计数据进行了联合基于基因的关联测试。
结果:我们发现了3本小说VPS35在3个案例中改变编码氨基酸的变异(非同义)。在多重家庭中有两种变异,都没有与PD分离。在EIF4G1我们鉴定了11个(9个非同义型和2个小型)rv,包括报道的致病突变p.R1205H,该突变分离于一个大家族的所有患病成员中,但也分离于1个未受影响的86岁家庭成员中。仅在隔离患者中发现了另外两例rv。而最初的关联研究表明,关联(p= 0.04),所有的房车EIF4G1随后在第二个数据集(p.F1461)中对驱动变异(p.F1461)的测试表明,基因中的rv与PD之间没有关联。
结论:我们确认具体EIF4G1变异p.R1205H似乎是一个很强的PD危险因素,但在至少一位86岁的老人中没有渗透性。两个基因中的其他一些选择rv不能被排除为因果关系。然而,没有证据表明遗传变异对糖尿病的总体贡献VPS35或EIF4G1到我们数据集的PD开发。
术语表
- 阳极氧化铝=
- 发病年龄;
- EIF4G1 =
- 真核翻译起始因子4 γ 1;
- 电动汽车=
- Exome变体服务器;
- ICD=
- 内部控制数据库;
- nsRV=
- 非同义稀有变体;
- PD=
- 帕金森病;
- 房车=
- 罕见的变异;
- 纸牌游戏=
- 序列核关联检验;
- 单核苷酸多态性=
- 单核苷酸多态性;
- 深水救生艇=
- 同义稀有变体;
- VPS35 =
- 液泡蛋白分选;
- 韦斯=
- 全外显子组测序
脚注
去半岛投注体育官网Neurology.org全面披露。作者认为相关的资金信息和披露,如果有的话,将在本文的末尾提供。
编辑、页面974
- 收到了2012年7月9日。
- 接受2012年10月8日。
- ©2013美国神经病学学会半岛投注体育官网
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